Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lhx3P50481 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lhx3P50481 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms