Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SftpdP50404 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SftpdP50404 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SftpdP50404 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SftpdP50404 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpdP50404 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpdP50404 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpdP50404 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpdP50404 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SftpdP50404 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms