Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod1P49813 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmod1P49813 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms