Protein–RNA interactions for Protein: P48543

Kcnj9, G protein-activated inward rectifier potassium channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnj9P48543 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kcnj9P48543 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms