Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VdrP48281 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VdrP48281 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VdrP48281 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VdrP48281 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VdrP48281 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VdrP48281 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VdrP48281 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VdrP48281 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VdrP48281 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VdrP48281 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VdrP48281 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VdrP48281 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VdrP48281 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VdrP48281 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VdrP48281 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VdrP48281 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
VdrP48281 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VdrP48281 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VdrP48281 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VdrP48281 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VdrP48281 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VdrP48281 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VdrP48281 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
VdrP48281 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VdrP48281 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VdrP48281 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VdrP48281 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VdrP48281 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VdrP48281 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VdrP48281 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VdrP48281 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VdrP48281 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VdrP48281 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VdrP48281 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
VdrP48281 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VdrP48281 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VdrP48281 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VdrP48281 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VdrP48281 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VdrP48281 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
VdrP48281 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VdrP48281 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VdrP48281 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
VdrP48281 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VdrP48281 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VdrP48281 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VdrP48281 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VdrP48281 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VdrP48281 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VdrP48281 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VdrP48281 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VdrP48281 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VdrP48281 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VdrP48281 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VdrP48281 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VdrP48281 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VdrP48281 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VdrP48281 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
VdrP48281 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VdrP48281 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VdrP48281 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VdrP48281 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VdrP48281 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VdrP48281 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VdrP48281 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
VdrP48281 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
VdrP48281 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VdrP48281 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VdrP48281 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VdrP48281 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VdrP48281 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VdrP48281 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VdrP48281 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VdrP48281 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VdrP48281 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VdrP48281 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VdrP48281 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VdrP48281 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VdrP48281 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VdrP48281 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VdrP48281 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
VdrP48281 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
VdrP48281 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VdrP48281 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VdrP48281 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VdrP48281 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VdrP48281 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VdrP48281 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VdrP48281 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VdrP48281 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VdrP48281 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VdrP48281 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
VdrP48281 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
VdrP48281 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VdrP48281 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
VdrP48281 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VdrP48281 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VdrP48281 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
VdrP48281 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms