Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gbx2P48031 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gbx2P48031 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms