Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl5P47962 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl5P47962 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl5P47962 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl5P47962 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl5P47962 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl5P47962 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl5P47962 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl5P47962 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl5P47962 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl5P47962 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl5P47962 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl5P47962 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl5P47962 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl5P47962 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl5P47962 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl5P47962 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl5P47962 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl5P47962 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl5P47962 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl5P47962 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl5P47962 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl5P47962 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl5P47962 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl5P47962 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl5P47962 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl5P47962 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl5P47962 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rpl5P47962 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms