Protein–RNA interactions for Protein: P47878

Igfbp3, Insulin-like growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp3P47878 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Igfbp3P47878 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Igfbp3P47878 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Igfbp3P47878 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Igfbp3P47878 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Igfbp3P47878 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Igfbp3P47878 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Igfbp3P47878 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Igfbp3P47878 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Igfbp3P47878 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Igfbp3P47878 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Igfbp3P47878 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Igfbp3P47878 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Igfbp3P47878 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Igfbp3P47878 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Igfbp3P47878 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Igfbp3P47878 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Igfbp3P47878 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Igfbp3P47878 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Igfbp3P47878 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Igfbp3P47878 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Igfbp3P47878 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Igfbp3P47878 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms