Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg3P47867 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg3P47867 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg3P47867 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg3P47867 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg3P47867 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg3P47867 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scg3P47867 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms