Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrprbP47758 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrprbP47758 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrprbP47758 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrprbP47758 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrprbP47758 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrprbP47758 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrprbP47758 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrprbP47758 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SrprbP47758 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms