Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic1P46684 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic1P46684 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic1P46684 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic1P46684 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zic1P46684 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms