Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sdc2P43407 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms