Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VhlP40338 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VhlP40338 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VhlP40338 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VhlP40338 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VhlP40338 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
VhlP40338 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
VhlP40338 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
VhlP40338 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
VhlP40338 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
VhlP40338 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
VhlP40338 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
VhlP40338 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
VhlP40338 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
VhlP40338 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
VhlP40338 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
VhlP40338 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VhlP40338 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VhlP40338 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VhlP40338 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VhlP40338 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VhlP40338 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
VhlP40338 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
VhlP40338 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VhlP40338 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
VhlP40338 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VhlP40338 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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