Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vps26aP40336 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vps26aP40336 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms