Protein–RNA interactions for Protein: P39038

Cdh4, Cadherin-4, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh4P39038 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cdh4P39038 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh4P39038 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms