Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin1P35438 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin1P35438 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin1P35438 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Grin1P35438 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin1P35438 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin1P35438 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin1P35438 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Grin1P35438 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms