Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp4P35123 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp4P35123 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp4P35123 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp4P35123 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms