Protein–RNA interactions for Protein: P34968

Htr2c, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr2cP34968 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Htr2cP34968 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Htr2cP34968 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms