Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tfap2aP34056 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms