Protein–RNA interactions for Protein: P33610

Prim2, DNA primase large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim2P33610 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim2P33610 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim2P33610 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim2P33610 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim2P33610 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim2P33610 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim2P33610 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim2P33610 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prim2P33610 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prim2P33610 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prim2P33610 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prim2P33610 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prim2P33610 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prim2P33610 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prim2P33610 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms