Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nedd1P33215 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nedd1P33215 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms