Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa10P31310 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms