Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxa2P31245 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms