Protein–RNA interactions for Protein: P30873

Sstr1, Somatostatin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sstr1P30873 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sstr1P30873 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms