Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msr1P30204 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msr1P30204 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Msr1P30204 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Msr1P30204 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msr1P30204 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msr1P30204 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msr1P30204 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msr1P30204 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Msr1P30204 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms