Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VtnP29788 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VtnP29788 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VtnP29788 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VtnP29788 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VtnP29788 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VtnP29788 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VtnP29788 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VtnP29788 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VtnP29788 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VtnP29788 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VtnP29788 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VtnP29788 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VtnP29788 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VtnP29788 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VtnP29788 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VtnP29788 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VtnP29788 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VtnP29788 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VtnP29788 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VtnP29788 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VtnP29788 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VtnP29788 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VtnP29788 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VtnP29788 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
VtnP29788 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
VtnP29788 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VtnP29788 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VtnP29788 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VtnP29788 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
VtnP29788 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
VtnP29788 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
VtnP29788 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VtnP29788 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VtnP29788 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VtnP29788 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VtnP29788 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VtnP29788 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VtnP29788 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VtnP29788 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VtnP29788 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VtnP29788 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VtnP29788 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VtnP29788 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VtnP29788 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VtnP29788 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VtnP29788 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VtnP29788 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VtnP29788 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
VtnP29788 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
VtnP29788 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
VtnP29788 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VtnP29788 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VtnP29788 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VtnP29788 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VtnP29788 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VtnP29788 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VtnP29788 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VtnP29788 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
VtnP29788 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
VtnP29788 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VtnP29788 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
VtnP29788 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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