Protein–RNA interactions for Protein: P29268

Ctgf, Connective tissue growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtgfP29268 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtgfP29268 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CtgfP29268 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtgfP29268 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtgfP29268 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtgfP29268 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CtgfP29268 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CtgfP29268 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CtgfP29268 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtgfP29268 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CtgfP29268 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CtgfP29268 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtgfP29268 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CtgfP29268 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtgfP29268 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtgfP29268 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtgfP29268 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtgfP29268 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CtgfP29268 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtgfP29268 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtgfP29268 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtgfP29268 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CtgfP29268 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CtgfP29268 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtgfP29268 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CtgfP29268 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtgfP29268 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CtgfP29268 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtgfP29268 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtgfP29268 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtgfP29268 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtgfP29268 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CtgfP29268 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CtgfP29268 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CtgfP29268 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtgfP29268 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CtgfP29268 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtgfP29268 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtgfP29268 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtgfP29268 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtgfP29268 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtgfP29268 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtgfP29268 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtgfP29268 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtgfP29268 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtgfP29268 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtgfP29268 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CtgfP29268 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtgfP29268 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtgfP29268 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtgfP29268 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtgfP29268 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtgfP29268 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtgfP29268 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CtgfP29268 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtgfP29268 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtgfP29268 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtgfP29268 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtgfP29268 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtgfP29268 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtgfP29268 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtgfP29268 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtgfP29268 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CtgfP29268 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtgfP29268 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtgfP29268 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtgfP29268 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CtgfP29268 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtgfP29268 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtgfP29268 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtgfP29268 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtgfP29268 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CtgfP29268 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CtgfP29268 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms