Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Kif5cP28738 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kif5cP28738 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms