Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Col2a1P28481 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Col2a1P28481 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms