Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Hoxd10P28359 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Hoxd10P28359 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Hoxd10P28359 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hoxd10P28359 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Hoxd10P28359 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Hoxd10P28359 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Hoxd10P28359 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Hoxd10P28359 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Hoxd10P28359 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Hoxd10P28359 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hoxd10P28359 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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