Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa5P28312 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa5P28312 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa5P28312 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa5P28312 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa5P28312 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa5P28312 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa5P28312 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa5P28312 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Defa5P28312 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms