Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LoxP28301 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LoxP28301 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LoxP28301 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LoxP28301 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LoxP28301 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LoxP28301 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LoxP28301 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LoxP28301 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LoxP28301 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LoxP28301 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LoxP28301 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LoxP28301 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LoxP28301 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LoxP28301 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LoxP28301 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LoxP28301 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LoxP28301 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LoxP28301 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LoxP28301 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LoxP28301 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LoxP28301 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LoxP28301 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LoxP28301 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LoxP28301 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LoxP28301 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LoxP28301 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LoxP28301 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LoxP28301 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LoxP28301 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LoxP28301 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LoxP28301 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LoxP28301 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
LoxP28301 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LoxP28301 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LoxP28301 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LoxP28301 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LoxP28301 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LoxP28301 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LoxP28301 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LoxP28301 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LoxP28301 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LoxP28301 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LoxP28301 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LoxP28301 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LoxP28301 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LoxP28301 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LoxP28301 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LoxP28301 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LoxP28301 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LoxP28301 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LoxP28301 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LoxP28301 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LoxP28301 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LoxP28301 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LoxP28301 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LoxP28301 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LoxP28301 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LoxP28301 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LoxP28301 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LoxP28301 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LoxP28301 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LoxP28301 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LoxP28301 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LoxP28301 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LoxP28301 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LoxP28301 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LoxP28301 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LoxP28301 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LoxP28301 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LoxP28301 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LoxP28301 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LoxP28301 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LoxP28301 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LoxP28301 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms