Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb1P28230 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms