Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CebpbP28033 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CebpbP28033 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CebpbP28033 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CebpbP28033 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CebpbP28033 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CebpbP28033 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CebpbP28033 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CebpbP28033 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CebpbP28033 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CebpbP28033 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CebpbP28033 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CebpbP28033 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CebpbP28033 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms