Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl3P27659 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms