Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PdgfraP26618 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfraP26618 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms