Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CftrP26361 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CftrP26361 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CftrP26361 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CftrP26361 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CftrP26361 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CftrP26361 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CftrP26361 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CftrP26361 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CftrP26361 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CftrP26361 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CftrP26361 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CftrP26361 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CftrP26361 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CftrP26361 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CftrP26361 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CftrP26361 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CftrP26361 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CftrP26361 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CftrP26361 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CftrP26361 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CftrP26361 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CftrP26361 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CftrP26361 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CftrP26361 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CftrP26361 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CftrP26361 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CftrP26361 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CftrP26361 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CftrP26361 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CftrP26361 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CftrP26361 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CftrP26361 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CftrP26361 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CftrP26361 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CftrP26361 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CftrP26361 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CftrP26361 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CftrP26361 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CftrP26361 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CftrP26361 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CftrP26361 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CftrP26361 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CftrP26361 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CftrP26361 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CftrP26361 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CftrP26361 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CftrP26361 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CftrP26361 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CftrP26361 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CftrP26361 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CftrP26361 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CftrP26361 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CftrP26361 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CftrP26361 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CftrP26361 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CftrP26361 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CftrP26361 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CftrP26361 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CftrP26361 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CftrP26361 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CftrP26361 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CftrP26361 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CftrP26361 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CftrP26361 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CftrP26361 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CftrP26361 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CftrP26361 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CftrP26361 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CftrP26361 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CftrP26361 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CftrP26361 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CftrP26361 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CftrP26361 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CftrP26361 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CftrP26361 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CftrP26361 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CftrP26361 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CftrP26361 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CftrP26361 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CftrP26361 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CftrP26361 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CftrP26361 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CftrP26361 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CftrP26361 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CftrP26361 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CftrP26361 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CftrP26361 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CftrP26361 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CftrP26361 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CftrP26361 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CftrP26361 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CftrP26361 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CftrP26361 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CftrP26361 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CftrP26361 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CftrP26361 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CftrP26361 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CftrP26361 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CftrP26361 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms