Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gabra3P26049 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms