Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tsta3P23591 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms