Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gja1P23242 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja1P23242 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gja1P23242 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms