Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk1P22518 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk1P22518 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Clk1P22518 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms