Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tpm3P21107 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm3P21107 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms