Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ms4a2P20490 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms