Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fcer1aP20489 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms