Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkcaP20444 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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