Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pou5f1P20263 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pou5f1P20263 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms