Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NelfeP19426 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NelfeP19426 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NelfeP19426 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NelfeP19426 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NelfeP19426 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfeP19426 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfeP19426 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfeP19426 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfeP19426 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NelfeP19426 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms