Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RargP18911 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RargP18911 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RargP18911 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RargP18911 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RargP18911 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RargP18911 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RargP18911 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RargP18911 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RargP18911 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RargP18911 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RargP18911 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RargP18911 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RargP18911 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RargP18911 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RargP18911 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RargP18911 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RargP18911 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RargP18911 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RargP18911 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RargP18911 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RargP18911 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RargP18911 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RargP18911 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RargP18911 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RargP18911 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RargP18911 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RargP18911 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RargP18911 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RargP18911 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RargP18911 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RargP18911 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RargP18911 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RargP18911 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RargP18911 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RargP18911 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RargP18911 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RargP18911 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RargP18911 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RargP18911 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RargP18911 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RargP18911 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RargP18911 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RargP18911 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RargP18911 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RargP18911 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RargP18911 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RargP18911 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RargP18911 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RargP18911 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RargP18911 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RargP18911 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RargP18911 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RargP18911 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RargP18911 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RargP18911 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RargP18911 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RargP18911 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RargP18911 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RargP18911 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RargP18911 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RargP18911 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RargP18911 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RargP18911 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RargP18911 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RargP18911 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RargP18911 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RargP18911 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RargP18911 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RargP18911 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RargP18911 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RargP18911 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RargP18911 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RargP18911 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RargP18911 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RargP18911 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RargP18911 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RargP18911 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RargP18911 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RargP18911 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RargP18911 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RargP18911 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RargP18911 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RargP18911 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RargP18911 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RargP18911 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RargP18911 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RargP18911 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RargP18911 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RargP18911 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RargP18911 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RargP18911 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RargP18911 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RargP18911 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RargP18911 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RargP18911 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RargP18911 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RargP18911 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RargP18911 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RargP18911 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms