Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P18533 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18533 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18533 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18533 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18533 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P18533 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18533 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18533 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P18533 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18533 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18533 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18533 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18533 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18533 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18533 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P18533 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18533 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18533 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18533 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18533 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P18533 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18533 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18533 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18533 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18533 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18533 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18533 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18533 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18533 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18533 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18533 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18533 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18533 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18533 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18533 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P18533 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P18533 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18533 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18533 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18533 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P18533 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18533 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18533 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18533 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18533 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18533 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18533 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18533 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P18533 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18533 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18533 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18533 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P18533 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18533 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18533 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18533 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18533 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18533 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18533 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P18533 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18533 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18533 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18533 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18533 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18533 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18533 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18533 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18533 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18533 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18533 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18533 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18533 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P18533 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18533 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18533 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18533 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18533 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18533 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18533 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18533 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P18533 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18533 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18533 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18533 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18533 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P18533 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18533 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18533 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18533 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18533 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18533 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P18533 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18533 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P18533 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18533 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18533 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18533 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18533 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P18533 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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