Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18530 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18530 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18530 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18530 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18530 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18530 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18530 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18530 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18530 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18530 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18530 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18530 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18530 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18530 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18530 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18530 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18530 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18530 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18530 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18530 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18530 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18530 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
P18530 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
P18530 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
P18530 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18530 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18530 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
P18530 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18530 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18530 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18530 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
P18530 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18530 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18530 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18530 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18530 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18530 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18530 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18530 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18530 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18530 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18530 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18530 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18530 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18530 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18530 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18530 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18530 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
P18530 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
P18530 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
P18530 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms